UC 瑞旭观察：QSAR 模型软件合集及详解

定性（量）构效关系（QSAR），是使用数学模型来描述分子结构和某种生物活性之间的关系。这种关系，通常用一种算法将分子结构和分子的生物活性关联起来，比如线性回归、神经网络、支持向量机、遗传算法、决策树等等。简单的说，就是通过一些计算机模型来推测物质的某些性质或者活性。

常见的QSAR模型可分为规则模型（rule-based model）和统计模型（statistic-based model）。规则模型是基于专家经验所制定的各种规则所建立的；而统计模型则是基于回归分析、偏最小二乘、神经网络等数学模型所建立。现阶段常用的QSAR软件包括OECD Toolbox，T.E.S.T，VEGA等往往包括了两种模型，用户可以根据需要选择合适的模型。

以下针对市面上常用的免费QSAR软件进行介绍，包括OECD Toolbox、EPI SUITE、ECOSAR等。

QSAR toolbox （官方下载链接点击 这里 ）

由OECD和ECHA联合开发，共同拥有，在确保法规实施的同时，促进替代方法的使用。集成了大量的数据以及常见的QSAR模型，是一款功能非常强大的模型，能够进行数据查找，read-across预测，相似度分析，QSAR预测等，可预测理化、毒理、环境归趋和生态毒理相关性质，是ECHA推荐的预测皮肤致敏性QSAR软件之一。

EPI Suite （官方下载链接点击 这里 ）

由US EPA开发，由一系列软件集合而成，包括 KOWWIN™, AOPWIN™, HENRYWIN™, MPBPWIN™, BIOWIN™, BioHCwin, KOCWIN™, WSKOWWIN™, WATERNT™, BCFBAF™, HYDROWIN™, KOAWIN and AEROWIN™, WVOLWIN™, STPWIN™ ，LEV3EPI以及生态毒性预测ECOSAR™等十几个子软件，可预测理化、环境行为和生态毒理相关性质。

Toxtree （官方下载链接点击 这里 ）

由JRC开发，是一款功能齐全、灵活、用户友好的开源应用程序，主要通过应用决策树方法来估计毒性危害。目前业界应用场景最广泛的是进行Cramer分类，并将结果应用于TTC。

T.E.S.T. （官方下载链接点击 这里 ）

全称是The Toxicity Estimation Software Tool，由US EPA开发，是为了让用户能够使用定量结构-活性关系（QSAR）方法轻松评估化学品的毒性。可预测理化、毒理和生态毒理相关性质。T.E.S.T方法包括了分层方法，单模型方法，群体贡献法，最相邻方法，一致性方法，作用模式法，能根据物质在各个模型中的适用性给出一个综合的预测结果。

 VEGA （官方下载链接点击 这里 ）

由意大利Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri IRCCS开发，可预测包括致突变性，生殖毒性，致癌性在内的毒理、以及部分理化、生态毒理、环境归趋等十几个终点，并支持输出含预测结果的完整报告。

 Danish QSAR Database （官方下载链接点击 这里 ）

由丹麦技术大学(DTU)开发，包含了650,000多个物质信息，200多个QSAR模型，可用于预测理化性质, 环境归趋，蓄积性，生态毒理，代谢以及毒性等性质。

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